Seit 1989 besteht auf Initiative des damaligen Domkapellmeisters Werner Pees neben dem traditionellen Bamberger Domchor die Mädchenkantorei am Bamberger Dom. Der Chor hat sich als zuverlässige musikalische Gruppe an der Bischofskirche etabliert und nimmt einen festen Platz in der Liturgie ein. Neben der musikalischen Mitgestaltung der Kapitelsgottesdienste im Dom ist die Mädchenkantorei auch bei Konzerten zu hören. Momentan gehören der Mädchenkantorei ca. 60 Mädchen im Alter von 7 – 20 Jahren an.
Trotz des angestrebten hohen Niveaus soll das Singen in der Mädchenkantorei eine angenehme Form der Freizeitgestaltung bleiben. So sind im Jahresprogramm des Chores auch immer wieder gemeinsame Freizeitaktivitäten außermusikalischer Art enthalten. Die Mädchenkantorei unternimmt regelmäßige Konzertreisen im In- und Ausland wie z. B. nach Belgien, England, Tschechien, Schweden, Italien, Frankreich, Ungarn, Polen und Luxemburg. Ein besonderes Highlight erlebten die Mädchen im September 2017: sie waren 13 Tage lang auf Konzertreise in Kanada unterwegs. Daneben finden Begegnungen mit anderen Chören statt, zuletzt mit den Mädchenkantoreien des Paderborner Doms, Freiburger Münsters, dem Christ Church Cathedral Girls' Choir Ottawa und der Jugendkantorei am Stockholmer Dom.
Zur Erfolgsbilanz der Mädchenkantorei gehört auch die erfolgreiche Teilnahme bei Chorwettbewerben (1. Platz beim Bayerischen Chorwettbewerb 1997 und 2005, sehr gute Bewertungen beim Deutschen Chorwettbewerb 1998 und 2006). Stolz sind die Sängerinnen auch auf gelungene Fernseh-, Rundfunk- und CD-Produktionen.
Die Mädchenkantorei am Bamberger Dom steht seit Mai 2022 unter der Leitung von Domkapellmeister Vincent Heitzer